Κάθε χρόνο μία από τις σημαντικότερες ετήσιες υποχρεώσεις των επιχειρήσεων είναι η υποβολή της εκκαθαριστική δήλωσης ΦΠΑ. Βάσει του άρθρου 38 του Ν.2859/2000 οι υπόχρεοι στο φόρο που ενεργούν φορολογητέες πράξεις ή πράξεις απαλλασσόμενες του φόρου, με δικαίωμα έκπτωσης του φόρου εισροών, οφείλουν να υποβάλλουν εκτός από τις περιοδικές δηλώσεις και εκκαθαριστική δήλωση Φ.Π.Α..